Nekas, kamēr neuztaisīsi alter type innodb. Bet vieta no kopējā kluča neabrīvosies. Ja to grib atbrīvot, tad sataisa visām db backupus (dumpus), nodroppo visas DB, apstādina mysql un izdzēš to kluci kopā ar innodb log. Piestartējam un attjaunojam DB no dumpa.